中科南京生命健康高等研究院设有蛋白技术中心、实验动物中心（SPF级屏障动物中心）、通用技术中心、生物安全二级实验中心和检测中心等五大技术中心为新型疫苗、抗体及分子和免疫诊断三大关键共性技术研发转化平台提供技术支撑。

各中心的总体目标是为生物医药相关科学研究及实验操作提供设备支撑与技术服务，为科研工作提供所需仪器设备以及高精尖仪器的技术服务。高研院具有高水平的技术团队与高质量的仪器设备，并对照国家要求，对技术人员及仪器设备实行规范的管理及运行模式，为科研工作提供高水平、深层次的技术支撑与服务。